甲醛碳原子以三個sp的平方雜化軌道形成三個鍵。其中一個是和氧形成一個鍵。這三個鍵在同一平面上。碳原子的一個p軌道和氧的一個p軌道彼此重疊起來形成一個派鍵。與這三個鍵所成的平面垂直。鍵角HCH等於111、5度，角HCO等於121、8度。鍵長CH鍵是120.3pm，CO鍵110pm。正負電荷中心不能重合，所以是極性分子。
區分極性分子和非極性分子的方法：
非極性分子的判據：中心原子化合價法和受力分析法。
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