事業單位能開增值税專用發票。如果是涉税的事業單位,在税務登記時會確定你是一般納税人還是小規模納税人,前者可以申領並開具增值税專用發票及普通發票,後者只能申領並開具普通發票,但對方要求提供專用發票的,可以申請税務代開。