電鏡下核膜的結構特點為核膜由內外兩層單位膜組成,每層膜厚約6、5毫微米,兩層膜間隙寬約10到30毫微米,核膜外層的外表面附有核糖體顆粒。有的細胞中,外膜與粗麵內質網膜相連續。核膜內層的內表面上,有一層由多肽物質組成的網架,核膜上還有許多散在的孔,核膜並不是完全連續的,有許多部位內外膜互相連線,形成穿過核膜的核孔。
核仁的結構為核仁有超微結構有纖維中心FC、緻密纖維組分DFC、顆粒組分GC三個特徵性的區域。