防城區中學有:1.防城中學,前身為清未三都書院,是防城港歷史悠久的中學。2.防城港市實驗高階中學,其前身是創辦於1961年的廣西省東興縣師範附小。
港口區中學有:1.防城港市第一中學,創建於1987年。2.防城港市高階中學,創建於2000年。
防城港沒有大學。